W połowie 1974 przeszedł do beniaminka najwyższej klasy rozgrywkowej, Atlético Potosino, gdzie również nie zdobył żadnego trofeum i zakończył karierę piłkarską w wieku 32 lat.
Kariera trenerska Zaraz po zakończeniu piłkarskiej kariery Guerra znalazł zatrudnienie w swoim ostatnim klubie, Atlético Potosino, gdzie początkowo trenował juniorów i rezerwy, zaś w połowie 1978 roku został szkoleniowcem pierwszego zespołu, zastępując na tym stanowisku Luisa Grilla. Pracował tam przez kolejne cztery lata, nie zdobywając żadnego trofeum, lecz osiągał ponadprzeciętne wyniki jak na możliwości drużyny; w rozgrywkach 1978/1979 zajął nawet drugie miejsce w tabeli regularnego sezonu. W 1982 roku podpisał umowę z kolejnym ze swoich byłych klubów, Chivas de Guadalajara, gdzie spędził w roli trenera kolejne siedem lat. Już w pierwszym sezonie, 1982/1983, zdobył z tą drużyną wicemistrzostwo Meksyku, sukces ten powtarzając również rok później, podczas rozgrywek 1983/1984. W sezonie 1986/1987 doprowadził za to Chivas do pierwszego od siedemnastu lat tytułu mistrzowskiego.