Alpen Cup w skokach narciarskich 2008/2009 – dziewiętnasta edycja tego pucharu, która rozpoczęła się 5 września 2008 w Predazzo, a zakończyła się wcześniej niż planowano, czyli 25 stycznia 2009 w Reit im Winkl. Cykl składał się z dziesięciu konkursów, z czego dwa ostatnie w Kranju się nie odbyły.
Klasyfikację generalną zwyciężył Lukas Müller przed swoimi rodakami Michaelem Hayböckiem i Manuelem Poppingerem.
Kalendarz i wyniki LpDataMiejscowośćSkoczniaHSUwagi 1. miejsce2. miejsce3. miejsce1.5 września 2008 PredazzoTrampolino Dal BenHS106SAGP Lukas Müller Michael Hayböck Danny Queck2.6 września 2008 Lukas Müller Michael Hayböck Johannes Lenz3.4 października 2008 OberstdorfSchattenbergschanzeHS100SAGP Lukas Müller Manuel Poppinger Michael Hayböck4.5 października 2008 Lukas Müller Michael Hayböck Nico HermannSommer Alpen Grand Prix – klasyfikacja końcowa Lukas Müller Michael Hayböck Nico Hermann5.19 grudnia 2008 SeefeldToni-Seelos-OlympiaschanzeHS100– Lukas Müller Manuel Poppinger Rožle Žagar6.20 grudnia 2008 Lukas Müller Michael Hayböck Johannes Lenz7.24 stycznia 2009 Reit im WinklFranz-Haslberger-SchanzeHS93– Richard Freitag Thomas Thurnbichler Mario Innauer8.25 stycznia 2009 Richard Freitag Florian Schabereiter Dejan Judež–14 lutego 2009 KranjBauhenkHS109–align=center colspan=3 –15 lutego 2009align=center colspan=3 Alpen Cup