Wzrosło też przyśpieszenie rozruchu – zwłaszcza przy większych prędkościach, które jest realizowane przy mniejszym osłabieniu wzbudzenia (i tym samym większej mocy silników). Nowe silniki trakcyjne LKb535, zamiast EE541 dostosowane są do wyższej dopuszczalnej temperatury pracy. Maksymalna dopuszczalna prędkość obrotowa silników EE541b to 2390 obr./min, w lokomotywach serii EU07 przy maksymalnie zużytych obręczach zestawów kołowych i prędkości 120 km/h silniki trakcyjne osiągają prędkość obrotową 2380 obr./min, a silniki w EP07 w tej samej sytuacji osiągają jedynie 1962 obr./min. co zwiększa ich trwałość.
Przebudowane egzemplarze zachowywały swój numer taborowy (np. lokomotywa EU07-351 stała się lokomotywą EP07-351).
W grudniu 2006 roku 74 lokomotywy EP07 i EU07 należące do PKP Cargo zostały sprzedane do spółki PKP Przewozy Regionalne. Lokomotywy te zostały zmodernizowane, w EU07 zmieniana jest przekładnia główna. Ponadto otrzymały one nowe malowanie, demontowano gniazda sterowania wielokrotnego, kabiny maszynisty otrzymały izolację cieplną i akustyczną oraz nowe fotele maszynisty i pomocnika, a także zabudowywano elektryczne wycieraczki i reflektory halogenowe. Lokomotywy otrzymały nową numerację od 1001 wzwyż.