System rządów wojskowych miał być przejściowyGaspari, A Ditadura Envergonhada, s. 141–142. jednak szybko zmienił się w dyktaturęGaspari, A Ditadura Envergonhada, s. 35.. Reżim szeroko stosował represje polityczne względem swoich przeciwników, w tym artystów i dziennikarzy. W opozycji przeciw rządom wojskowym doszło do powstania zbrojnych ruchów partyzanckichRichard Young, Odile Cisneros, Historical Dictionary of Latin American Literature and Theater, Scare Crow Press 2011, s. 224.Crocitti, John J. Brazil Today; an Encyclopedia of Life in the Republic ABC-Clio 2012 s. 395.. Rząd Brazylii zobowiązał się w ramach operacji Kondor wyeliminować także opozycję na emigracjiLaurence Burgorgue-Larsen & Amaya Úbeda de Torres The Inter-American Court of Human Rights: Case Law and Commentary Oxford University Press 2011 s. 29. W 1967 roku w regionie Goiás rozpoczęła się regularna rebelia zorganizowana przez maoistowską KPB. Trwała ona do 1972 rokuMarcelo Ridenti, O fantasma da revolução brasileira, São Paulo: UNESP, 1993, s. 232.. W większych miastach z kolei działalność rozpoczęły miejskie guerille w tym m.in. Armia Wyzwolenia NarodowegoRose, R. S. (2005). The unpast: elite violence and social control in Brazil, 1954-2000. Ohio University Press. s. 170–178. ..