Wyposażenie i wystrój Znaczna część wyposażenia i wystroju kościoła pochodzi z ok. 1900 roku i jest wykonana przez krakowskich artystów w stylu młodopolskim. Z wcześniejszego wyposażenia zachowały się dwa barokowe ołtarze boczne, renesansowe tabernakulum oraz figura Chrystusa Ecce Homo z XVIII wieku.
Rzeźby Wacława Bębnowskiego Zespół rzeźb w kościele w Służewie stanowi najważniejsze dzieło w dorobku rzeźbiarza. W jego skład wchodzą:
ołtarz główny z rzeźbami: Madonna z Dzieciątkiem, św. Jan Chrzciciel i Pietà; dekoracja rzeźbiarska w prezbiterium: 12 rzeźb w niszach; galeria rzeźb nad wejściem do zakrystii przedstawiająca osoby z rodu Wodzińskich; chrzcielnica ze sceną Wygnanie z Raju i płaskorzeźbą przedstawiającą Trójcę Świętą; ambona z przedstawieniami czterech ewangelistów; figury Jezusa Chrystusa i apostołów na balustradzie chóru muzycznego.
Witraże W kościele znajduje się sześć historycznych witraży dopełniających aranżację wnętrza z przełomu XIX i XX wieku: