Najbardziej znaną publikacją CSI jest magazyn Skeptical Inquirer. Pismo zostało założone przez Marcella Truzziego pod nazwą The Zetetic, a następnie przemianowane; wieloletnim redaktorem był Kendrick Frazier. W czerwcu 2023 redaktorem magazynu został Stephen Hupp. CSI wydaje również kwartalny newsletter Skeptical Briefs.
W ramach działalności publicznej CSI organizował konferencje poświęcone sceptycyzmowi naukowemu, pseudonauce i komunikacji naukowej. Po kilkuletniej przerwie wznowiono je w październiku 2011 w Nowym Orleanie pod nazwą CSICon. Organizacja wspierała również oddolne inicjatywy sceptyczne, takie jak konferencje SkeptiCamp. W historycznych opisach działalności CSICOP podkreśla się także jego rolę jako organizacji zabiegającej o bardziej krytyczne i odpowiedzialne przedstawianie zjawisk paranormalnych w mediach oraz nagradzającej autorów i dziennikarzy, którzy omawiali takie tematy z perspektywy naukowej.
CSI prowadzi i publikuje analizy dotyczące między innymi twierdzeń o UFO, zjawisk paranormalnych, parapsychologii, astrologii, medycyny alternatywnej i innych form pseudonauki.