Biskupstwo Dopiero po śmierci Bonifacego w 755 roku Wirgiliusz otrzymał sakrę biskupią. Zrezygnował z wyprawy do Ziemi Świętej i poszedł w ślady św. Ruperta, pierwszego biskupa Salzburga i apostoła Austrii. Przyczynił się do chrystianizacji zamieszkujących Karyntię Słowian. Wybudował w Salzburgu obiekt sakralny (niem. Salzburger Dom spalony w 1167) poświęcony świętym: Piotrowi i RupertowiDzisiejsza katedra, wybudowana w miejsce spalonej, dedykowana jest obu świętym patronom: Rupertowi i Wirgiliuszowi. Przed główną elewacją znajdują się 4 pomniki świętych: Piotra i Pawła, oraz Ruperta i Wirgiliusza (za niem. źródłem)., do którego 24 września 774 przeniósł relikwie św. Ruperta zmarłego w Wormacji, uważanego za założyciela miasta. Zmarł i pochowany został w Salzburgu. Jego grób odkryto ponownie w 1181 roku przy kolejnej odbudowie kościoła.
Kult Jego wspomnienie liturgiczne obchodzone jest w dzienną pamiątkę śmierci. W niektórych diecezjach Irlandii, Niemczech i Austrii (w tym w Salzburgu) św. Wirgiliusz wspominany jest uroczyście 24 września na pamiątkę przeniesienia relikwii św. Ruperta.
Jest patronem miasta, diecezji i landu Salzburg oraz diecezji Graz-Seckau a także Austrii. Jest orędownikiem przeciw skomplikowanym narodzinom dzieci.
W austriackim miasteczku Maria Saal (k.