Od grudnia 1962 do grudnia 1966 dowódca 8 Dywizji Zmechanizowanej w Koszalinie.
W październiku 1963 w Belwederze przewodniczący Rady Państwa Aleksander Zawadzki w obecności ministra obrony narodowej Mariana Spychalskiego wręczył mu akt mianowania na stopień generała brygady.
Od 1 kwietnia 1967 do 30 września 1970 był komendantem Wyższej Szkoły Oficerskiej Wojsk Zmechanizowanych im. T. Kościuszki we Wrocławiu. Później był zastępcą szefa sztabu Śląskiego Okręgu Wojskowego. Od 1973 do 1981 szef Wojewódzkiego Sztabu Wojskowego w Krakowie. We wrześniu 1981 pożegnany przez wiceministra obrony narodowej gen. broni Józefa Urbanowicza i przeniesiony do rezerwy ze względu na stan zdrowia. Pochowany na cmentarzu Batowickim w Krakowie (kw. E-XV-zach.-10). mały|Grób gen. Zdzisława Kwiatkowskiego na Cmentarzu Batowickim
Działalność agenturalna W Archiwum Instytutu Pamięci Narodowej znajduje się teczka personalna nr 4162 rezydenta ps. „Kruk” (Zdzisław Kwiatkowski s. Stanisława, ur. 10 czerwca 1924 we Włodzimierzu Wołyńskim), sygn.