30 czerwca 2016 został członkiem Rady Pracodawców Rzeczypospolitej Polskiej w randze wiceprezydenta. W połowie grudnia tamtego roku przestał być dyrektorem generalnym Pesy, ale pozostał prezesem jej zarządu. 26 czerwca 2017 Zaboklicki ustąpił ze stanowiska prezesa zarządu Pesy na rzecz Roberta Świechowicza, ale pozostał w radzie nadzorczej przedsiębiorstwa.
Życie prywatne Jego ojciec był żołnierzem, który należał do Armii Krajowej i walczył w powstaniu warszawskim. W latach 50. wraz z żoną Ireną przeprowadził się do Bydgoszczy i zamieszkał w bloku przy ul. Czerkaskiej na Osiedlu Leśnym. Tam w 1958 Tomasz Zaboklicki urodził się jako drugie dziecko w rodzinie, a następnie wychował. Gdy miał 9 lat, jego ojciec zmarł.
Tomasz Zaboklicki ma żonę Annę i dwójkę dorosłych dzieci. Interesuje się sportem: spadochroniarstwem, nurkowaniem i karate, w którym posiada tytuł sensei. Jego hobby są również podróże i książki.