18 października 1685, Ludwik XIV podpisał edykt z Fontainebleau cofający edykt z Nantes. Protestantyzm stał się zakazany w królestwie Francji. Po czym następuje okres prześladowań protestantów który doprowadził niektórych do emigracji. 7 listopada 1787, Ludwik XVI ustanawia edykt tolerancji prawnej dla protestantów. 26 sierpnia 1789, przyjęcie Deklaracji Praw Człowieka i Obywatela upowszechnia wolność religijną. W dniu 8 kwietnia 1802, Napoleon Bonaparte, w końcu oficjalnie przywrócił prawo dla kultu protestanckiego.
W dniu 25 października 1905 roku została utworzona Francuska Federacja Protestancka, jako unia Kościołów protestanckich, którą reprezentuje obecnie 23 Kościoły i związki wyznaniowe.
Statystyka Ważniejsze denominacje protestanckie we Francji: Kościoły Liczba wiernych Procent ludności Zjednoczony Kościół Protestancki Francji 400 tys. 0,6% Unia Kościołów Protestanckich Alzacji i Lotaryngii (UEPAL) 250 tys. 0,37% Cygańska Misja Ewangeliczna „Życie i Światło” ok. 140 tys. ok. 0,2% Zbory Boże we Francji 100–120 tys. 0,15–0,2% Kościół Ewangelicko-Luterański 40 tys. 0,06% Bracia plymuccy (CAEF) 24,5 tys. 0,04% Wspólnota Frankofońskich Kościołów Afrykańskich (CEAF) ok. 20 tys. 0,03% Federacja Ewangelicznych Kościołów Baptystycznych we Francji (FEEBF) ok. 20 tys.