W czasie rokowań w Kampali i Addis Abebie doszło do wewnętrznego rozłamu wśród ugrupowania M23. Przeciwko Bosco Ntagandzie i biskupowi Jean-Marie Runiga Lugerero, będącemu przywódcą politycznym M23, wystąpił Sultani Makenga wraz ze swoimi poplecznikami. Przyczyną napięcia wśród buntowników były odmienne stanowiska co do wycofania się z Gomy i toczących się wówczas rozmów pokojowych. Bosco Ntaganda ponownie chciał przejąć kontrolę nad Gomą, z kolei Makenga był ostrożniejszym dowódcą, który był skory przyjąć porozumienie z Addis Abeby. Runiga Lugerero oskarżył Makengę o układ z Kabilą i misję pojmania dowódców M23.
W efekcie bratobójczego konfliktu, do którego przyczyniło się brak wsparcia ze strony Rwandy, po sankcjach nakładanych przez państwa zachodnie na ten kraj, 18 marca 2013 Bosco Ntaganda pojawił się w ambasadzie USA w Kigali, stolicy Rwandy. Departament Stanu USA poinformował, że generał oddał się ręce amerykańskich dyplomatów i chce zostać przekazany Międzynarodowemu Trybunałowi Karnemu w Hadze. Po poddaniu się przez Ntagandę, wojskowym liderem M23 został Sultani Makenga, a politycznym Bertrand Bisimwa..