W listopadzie 2012 Fentanes został zatrudniony jako trenera drużyny San Luis FC przez nowego właściciela klubu Carlosa Lópeza Chargoya, zastępując ekwadorskiego szkoleniowca Álexa Aguinagę. Został zwolniony w lutym 2013 po tym, jak jego drużyna w siedmiu pierwszych kolejkach ligowego sezonu Clausura 2013 nie odniosła żadnego zwycięstwa, a jedyne trzy triumfy w roli trenera San Luis odniósł w krajowym pucharze. W kwietniu 2013 dołączył do zarządu klubu Jaguares de Chiapas z siedzibą w Tuxtla Gutiérrez, w którym pełnił rolę doradcy, zaś z początkiem 2014 roku objął funkcję asystenta wenezuelskiego trenera Césara Faríasa w ekipie Club Tijuana. We wrześniu tego samego roku został następcą Diego Torresa na stanowisku szkoleniowca drugoligowej filii Tijuany – zespołu Dorados de Sinaloa z miasta Culiacán. Z przeciętnym skutkiem prowadził ją przez dwa miesiące, zajmując dopiero jedenaste miejsce w lidze, po czym został zwolniony z powodu słabych wyników.
W maju 2015 Fentanes zastąpił Wilsona Graniolattiego w roli trenera drugoligowego klubu Atlante FC z siedzibą w Cancún.
Jego starszy brat Sergio Fentanes Orozco również jest trenerem piłkarskim.