Prowadził też własne prace nad Hügelkultur (tworzenie podniesionych grządek wypełnionych rozkładającym się drewnem) i swobodnym rozrostem gałęzi zamiast ich przycinania, aby umożliwić drzewom przetrwanie surowej zimy w wysokogórskich warunkach.
Prowadzi seminaria własnej permakultury („Permakultura Holzera”) zarówno na jego farmie Krameterhof jak i na całym świecie, kontynuując zarazem prace na własnej 45-ha farmie. Składają się na nią leśne ogrody i 70 oczek wodnych, mające opinię najbardziej spójnego przykładu permakultury na świecie.
Sepp Holzer ma za sobą liczne eksperymenty z pracą zwierząt. Holzer wykorzystuje naturalną skłonność świń do rycia do kopania nowych grządek. Wystarczy rzucić trochę kukurydzy i owoców w miejsce które chce mieć przekopane. Kilka dni później świnie prowadzone są do ich zwykłych miejsc, a na grządce można rozpocząć uprawę. Holzer nie używa żadnych nawozów, a po zasianiu czy zasadzeniu nie prowadzi dalszych prac nad tymi roślinami, pozostawiając ich wzrost naturze.
Holzer jest autorem kilku książek, doradcą międzynarodowym w dziedzinie ekologii oraz działa na arenie krajowej i międzynarodowej jako aktywista permakultury.
Nakręcono o nim 45-minutowy film dokumentalny pt. The Agro Rebel w reżyserii Bertrama Verhaaga.