Podczas rekonstrukcji rządu we wrześniu 2012 został awansowany na stanowisko szefa resortu.
W lutym 2013, The Daily Telegraph napisał o tym, jak Jones zażyczył sobie szofera z Jaguarem by przejechać 100 metrów, co potwierdził jego rzecznik.
W czasie kolejnej rekonstrukcji, w lipcu 2014, premier Cameron odwołał go ze składu rządu. W wyborach w 2015 uzyskał reelekcję na kolejną kadencję parlamentarną.
W 2014, Jones został oskarżony przez posła Guto Bebba z sąsiedniego okręgu wyborczego o bycie współautorem bloga "Thoughts of Oscar" ('Myśli Oscara'). Jones zaprzeczył udziału w blogu, za który miejscowy kioskarz Nigel Roberts wziął pełną odpowiedzialność. Richie Windmill, lider grupy aktywistów "Victims of Oscar" ('Ofiary Oscara') został aresztowany w październiku 2015, włącznie z niezaangażowaną w grupę żoną pod zarzutem nękania, ale zostali wypuszczeni bez zarzutów. Windmill jest zdania, że aresztowanie go było wynikiem zemsty Jonesa za pomoc w ujawnieniu jego tożsamości jako autora bloga "Thoughts of Oscar" i użycie powiązań, rzekomo masońskich, do umożliwienia aresztu.
Dzięki zaangażowaniu w Vote Leave (kampania na rzecz opuszczenia Unii Europejskiej), Jones został nominowany przez May jako minister ds. Opuszczenia Unii Europejskiej.