W 1993 roku, po uprzednim zwycięstwie w turnieju eliminacyjnym, wziął z nią udział w Młodzieżowych Mistrzostwach Świata w Australii, gdzie ekipa Meksyku, mająca w składzie piłkarzy takich jak Oswaldo Sánchez, Duilio Davino czy Rafael García, ponownie zakończyła swój udział w rozgrywkach na ćwierćfinale.
W tym samym 1993 roku Castillo poprowadził meksykańską kadrę młodzieżową na Igrzyskach Ameryki Środkowej i Karaibów w Portoryku, gdzie dotarł ze swoimi piłkarzami do finału, przegrywając w nim ostatecznie z Kostaryką i zdobywając srebrny medal. W grudniu 1994 został szkoleniowcem meksykańskiego klubu Tampico Madero FC z Primera División, którego barwy reprezentował wcześniej jako piłkarz. W sezonie 1994/1995 spadł z nim do drugiej ligi, po czym przez kilka miesięcy pełnił funkcję trenera zespołu Querétaro FC. W 1996 roku prowadził drugoligowe Club Saltillo i Atlético Yucatán, a w sezonie 1997/1998 był szkoleniowcem rezerw drużyny Club Santos Laguna z miasta Torreón. W 1998 roku objął stanowisko pierwszego trenera Santos Laguny i pozostawał na nim do października 1999, nie odnosząc większych sukcesów, podobnie jak w kolejnym zespole, drugoligowym Alacranes de Durango.