W sezonie klasy A drużyna zdobyła 2 punkty i w 1947 została objęta spadkiem do klasy B. W sezonie 1947/1948 Sanoczanka ponownie rywalizował w klasie B Grupie Południe.
W 1948 roku powołano sekcje juniorskie i trampkarzy. W sezonie 1949/1950 drużyna działała pod nazwą klubu ZKS Związkowiec Sanoczanka Sanok i występowała w B klasie Grupie Południowej. W latach 50. klub działał pod nazwą Górnika Sanok. Na przełomie 1950/1951 wraz z całym klubem sekcja piłkarska występowała po przemianowaną nazwą ZKS Unia Sanok. W sierpniu 1950 Unia zdobyła mistrzostwo na szczeblu powiatowym w edycji Pucharu Polski 1950/1951, pokonując LZS Zagórz 3:1 (1:1)W finale na szczeblu wojewódzkim Stal Rzeszów wygrała z Włókniarzem Krosno 3:2 (0:2), co oznacza, że Unia Sanok została wyeliminowana na wcześniejszym etapie. . 8 lipca 1951 pokonał na boisku w Zarszynie drużynę ZKS Włókniarza Rymanów 3:2 (0:0) w finale rozgrywek o mistrzostwo powiatu sanockiego, następnie we wrześniu 1951 wygrała grupę I w eliminacjach do klasy wojewódzkiej, w październiku i listopadzie 1951 w rozgrywce finałowej o wejście do klasy wojewódzkiej zajęła ostatnie miejsce w czterozespołowej grupie. Na początku grudnia 1951, już po powrotnym przemianowaniu klubu na Górnik Sanok, zespół pokonał LZS Zagórz 10:2 (5:1) w rozgrywce o puchar Powiatowego Komitetu Kultury Fizycznej (PKKF).