W 2008 r. pierwszy rząd Donalda Tuska przedłużył działanie strefy o 3 lata do końca 2020 r.(§ 1 ust. 3) Rozporządzenie Rady Ministrów z dnia 15 grudnia 2008 r. () W 2013 r. drugi rząd Donalda Tuska przedłużył działanie strefy o 6 lat do 2026 r.Rozporządzenie Rady Ministrów z dnia 23 lipca 2013 r. zmieniające rozporządzenie ()
Prezesami byli w latach 1997-2002 Jerzy KorolewiczJubileusz Kostrzyńsko-Słubickiej Specjalnej Strefy Ekonomicznej, Kostrzyńsko-Słubicka Specjalna Strefa Ekonomiczna S.A. [dostęp 2024-07-03], 2002-2006 Zbigniew FalińskiZmarł Zbigniew Faliński, były wojewoda i szef sejmiku lubuskiego [online], Wyborcza.pl, 14.11.2023 [dostęp 2024-07-03], 2006-2010 Krzysztof Dołganow, 2010-2016 Artur MalecKrzysztof Dołganow odwołany ze stanowiska prezesa K-SSSE [online], Gazeta Lubuska, 21 maja 2010 [dostęp 2024-07-03], 2016-2024 Krzysztof KielecJest nowy prezes w Kostrzyńsko-Słubickiej Specjalnej Strefie Ekonomicznej [online], Gazeta Lubuska, 26 lutego 2016 [dostęp 2024-07-03]. Od 2024 roku tę funkcję pełni Tomasz Pisarek.