Konstrukcję w 1904 r. rozebrano ze względu na zły stan techniczny. W latach 1937–1938 do zachodniej części nawy dobudowano wieżę z bocznymi przybudówkami i kruchtą, a na wieży zamontowano zegar. W końcu XX w. kościół był remontowany.
Kościoły filialne
Kościół Matki Bożej Częstochowskiej w Zielonej Górze - Zatoniu Świątynia została wybudowana w XVIII w. jako protestancki zbór o konstrukcji szachulcowej (tzw. mur pruski). Przestrzenie między drewnianymi belkami były od początku wypełnione cegłą. Budynek uzyskał kształt ośmioboku zwieńczonego wysokim dachem. Początkowo budynek nie posiadał wieży i przybudówki (obecnie zakrystia) i był kryty gontem. Z czasem do bryły kościoła dobudowano od strony północnej ceglaną wieżę z zegarem i klatką schodową. W roku 1871 przy kościele posadzono dąb na pamiątkę zjednoczenia Niemiec i osoby cesarza Fryderyka Wilhelma I. Upamiętnia to granitowy obelisk od strony zachodniej. Nieopodal kościoła wybudowano szkołę ewangelicką (obecnie budynek pod nr. 33 na tyłach kościoła) i okazały budynek domu parafialnego (obecnie przedszkole przy głównej drodze). Wewnątrz świątyni zachował się typowy dla zborów trójstronny chór. W surowych protestanckim wnętrzu uwagę przykuwa bogaty barokowy ołtarz i chrzcielnica oraz cenne organy na chórze z XVIII w.