poleceniem emerge --sync.
Flagi USE Flagi USE określają opcjonalne funkcje, które mają być włączone lub wyłączone podczas instalowania pakietów, i mogą wpływać także na zależności. Ustawienia globalne można definiować w pliku /etc/portage/make.conf, a ustawienia dotyczące poszczególnych pakietów w /etc/portage/package.use.
Słowa kluczowe i maskowanie Dla każdej obsługiwanej architektury pakiety mogą otrzymywać słowo kluczowe oznaczające wersję uznaną za stabilną albo słowo poprzedzone tyldą, np. amd64 i ~amd64. Użytkownik może dopuszczać wybrane pakiety testowe za pomocą /etc/portage/package.accept_keywords. Portage obsługuje również pliki package.mask i package.unmask, które pozwalają blokować lub jawnie odblokowywać określone wersje pakietów.
Pakiety binarne Portage od dawna obsługuje pakiety binarne równolegle z instalacją ze źródeł. W grudniu 2023 projekt Gentoo uruchomił oficjalne serwery pakietów binarnych: dla większości architektur obejmują one przede wszystkim system bazowy, natomiast dla AMD64 i ARM64 udostępniany jest znacznie szerszy zestaw pakietów.
Współczesny Portage obsługuje format GPKG, którego pliki mają rozszerzenie .gpkg.tar, a także starszy format XPAK używający plików .tbz2.