Rozbicie Poznańskiego OZPN, na pięć nowych okręgów powodowało ich słabość pozbawiając grające w nich drużyny konfrontacji z najsilniejszymi, a do takich należały przede wszystkim kluby z Poznania. W związku z taką sytuacją doszło w 1979 r., do porozumienia między okręgami i powstała Liga Międzyokręgowa Kalisz-Sieradz. Sezony 1979/1980–1982/1983 Prosna rozgrywała w Lidze Międzyokręgowej i wywalczyła w ostatnim z nich upragniony awans do III ligi. W sezonie 1983/1984 zakończyła rozgrywki w III lidze na 11 miejscu, zdobywając w 30 meczach, 29 punktów przy stosunku bramkowym 37:42 i utrzymała się na przyszły sezon. Sezon 1984/1985 dla Prosny nie był udany. Rozgrywki zakończyła na 14 pozycji, zdobywając w 30 meczach 23 punkty, przy stosunku bramkowym 22:48 i została zdegradowana. Sezony 1985/1986–2001/2002 to balansowanie drużyny między Ligą Okręgową, Międzyokręgową lub Makroregionalną. W sezonie 2002/2003 Prosna występowała w IV lidze (Wielkopolska południowa) i w połowie sezonu połączyła się z innym kaliskim klubem KKS (daw. Włókniarz). Nowa 'efemeryda" o nazwie KKS Prosna Kalisz zakończyła sezon na 10 miejscu, zdobywając w 34 meczach 44 punkty, przy stosunku bramkowym 54:56. Sezon 2003/2004 KKS Prosna Kalisz zakończyła na 13 miejscu, zdobywając w 30 meczach 37 punktów przy stosunku bramkowym 53:56.