W 2010 roku wziął udział w pierwszym międzynarodowym turnieju w karierze – Copa Libertadores, odpadając jednak z Bolívarem już w fazie grupowej.
Sezon Klub Kraj Rozgrywki Mecze Bramki 2000 CD San José
LFPB 0 0 2001 CD San José
LFPB 0 0 2002 CD San José
LFPB 38 0 2003 CD San José
LFPB 26 0 2004 CD San José
LFPB 34 0 2005 CD San José
LFPB 23 1 2006 CD San José
LFPB 19 1 2006 Real Potosí
LFPB 15 0 2007 The Strongest
LFPB 37 1 2008 The Strongest
LFPB 27 1 2009 Club Bolívar
LFPB 29 0 2010 Club Bolívar
LFPB 30 0 2011/2012 Club Bolívar
LFPB
Kariera reprezentacyjna W seniorskiej reprezentacji Boliwii Flores zadebiutował jeszcze jako zawodnik CD San José, w 2004 roku. Wówczas także znalazł się w ogłoszonym przez selekcjonera Ramiro Blacutta składzie na turniej Copa América, gdzie jednak odpadł już w fazie grupowej. Wystąpił w dwóch meczach wchodzących w skład eliminacji do Mistrzostw Świata 2006, na które Boliwijczycy się nie zakwalifikowali, podobnie jak na Mistrzostwa Świata 2010, do których Flores rozegrał siedem meczów eliminacyjnych.