Bauerowie uchodzili za protegowanych Himmlera i dzięki temu otrzymywali różnorodne zlecenia, m.in. na druk kart pocztowychPor. . Ich firma stała się przede wszystkim zakładem wydawniczym, ale napięcia między braćmi, doprowadziły do zerwania współpracy F. F. Bauer GmbH z WVHA. Jednak w 1942 r. F. F. Bauer GmbH powróciło do służby WVHA. Dzięki kontaktom Friedricha Franza Bauera z Himmlerem został on ponownie przyjęty przez Oswalda Pohla do tworzonego przez niego wydawnictwa Grossdeutscher Bilderdienst (od września 1942 r. Völkischer Kunstverlag).

Twórczość Wśród zdjęć wykonywanych przez Bauera dominują portrety wyższych funkcjonariuszy SS i przywódców NSDAP oraz fotografie mające uzasadnić zbrodniczą politykę prowadzoną przez nazistów, m.in. „wzorowe” funkcjonowanie KL Dachau czy Akcja T4. Jego prace ukazywały się w formie albumów oraz w czasopismach: Münchner Illustrierte Presse, Illustrierter Beobachter. Zwany był „osobistym fotografem Himmlera”.