Wszystkim oskarżonym zarzucano popełnienie zbrodni wojennych i przeciw ludzkości, a zwłaszcza mordowanie, katowanie, torturowanie i głodzenie więźniów obozu. Kompleks obozowy Mauthausen-Gusen był jednym z najgorszych z hitlerowskich obozów koncentracyjnych (poniosło w nim śmierć ok. 120 tysięcy ludzi). Trybunałowi wystarczyło 6 tygodni by uznać zarzuty stawiane oskarżonym za udowodnione. Wszyscy oskarżeni, w liczbie 61, zostali uznani za winnych, z czego 58 oskarżonych skazanych zostało na karę śmierci przez powieszenie (dziewięciu z nich zamieniono ją następnie na dożywotnie pozbawienie wolności), a jedynie trzech na karę dożywotniego pozbawienia wolności.
Wyrok Amerykańskiego Trybunału Wojskowego w procesie załogi Mauthausen (US vs. Johann Altfuldisch i inni): August Eigruber, gauleiter Górnej Austrii – śmierć przez powieszenie (wyrok wykonano) Johann Altfuldisch, kierownik obozu – śmierć przez powieszenie (wyrok wykonano) Viktor Zoller, adiutant komendanta obozu – śmierć przez powieszenie (wyrok wykonano) Adolf Zutter, adiutant komendanta obozu – śmierć przez powieszenie (wyrok wykonano) dr Eduard Krebsbach, naczelny lekarz obozowy – śmierć przez powieszenie (wyrok wykonano) dr Waldemar Wolter, naczelny lekarz obozowy – śmierć przez powieszenie (wyrok wykonano) dr Friedrich Entress, naczelny lekarz obozowy – śmierć