Brudziński po przeprowadzeniu szeregu eksperymentów na żabach, ptakach, psach i królikach doszedł do wniosku, że mechanizm objawów opiera się na podrażnieniu korzonków tylnych nerwów rdzeniowych i na zmianach w ciśnieniu wewnątrzczaszkowym. Do tematyki zapalenia opon powrócił w 1916 roku, publikując dwie prace, zawierające opisy kolejnych objawówBrudziński J. O nowej postaci objawu karkowego w zapaleniu opon mózgowo-rdzeniowych u dzieci, szczególnie gruźliczych: a) o objawie policzkowym b) o objawie spojenia łonowego. Gazeta Lekarska (1916). – określanych dziś jako objaw policzkowy (Brudzińskiego) i objaw łonowy (Brudzińskiego).
W pierwszych latach swojej pracy naukowej wiele prac poświęcił zagadnieniu biegunek u dzieci. Stwierdził obecność pałeczek Proteus („Bacillus proteus”) w stolcach niemowląt i zaproponował leczenie biegunek przez podawanie doustne antagonistycznych szczepów Lactobacillus („Bacillus lactis aerogenes”), później wykorzystaną m.in. przez Miecznikowa.
Lista prac
Ueber multiple Exostosen bei Kindern. Zentralblatt f Chir s. 978 (1902)
Słów kilka o nerce wędrującej u dzieci z powodu przypadku wrzekomej nerki wędrujacej u chłopca. Gazeta Lekarska 24, s. 43–49 (1904)
Brudziński J, Trenkner H. Przyczynek do leczenia płonicy surowicą przeciwpłoniczą. Czasopismo Lekarskie 8, s.