W roku 2000 nastąpiła zmiana uzbrojenia na zmodernizowany sprzęt S-125 Newa-SC.
W roku 2003 dywizjon przeniesiony został z Słupna do Sochaczewa (Bielice).
Decyzją Ministra Obrony Narodowej nr 626/MON z dnia 28 grudnia 2007, 5 dr OP obchodzi święto w dniu 23 lutegoDecyzja Nr 626 MON.
Decyzją MON nr Z-5/Org./P1 z dnia 28 stycznia 2011 roku oraz wykonawczym rozkazem Dowódcy Sił Powietrznych nr PF-95 z dnia 31 marca 2011 roku jednostkę rozformowano z dniem 31 grudnia 2011 roku.
Struktura dowództwo sztab bateria dowodzenia bateria radiotechniczna bateria startowa (S-125 Newa-SC)
Dowódcy dywizjonu 1960–1968 – mjr Jerzy Gaudasiński 1969–1975 – ppłk Jan Jakoniuk 1975–1982 – ppłk Zygmunt Grzonkowski 1982–1986 – mjr Marian Szelast 1986 – mjr Wiesław Dejer 1986–1989 – mjr Zygmunt Lis 1989 – ppłk Jan Wolski 1989–1996 – ppłk Zenon Kobus 1996–1998 – mjr Tadeusz Kozoń 1998–2000 – ppłk Kazimierz Walkowiak 2000–2002 – kpt. Andrzej Dąbrowski 2002–2004 – mjr Andrzej Polański 2004–31 grudnia 2005 – ppłk Jacek Bednarek 2006–2011 – ppłk Sławomir Rodak