w sprawie ustalenia granic niektórych gmin i miast oraz zmiany siedzib władz niektórych gmin ()) Wólka (województwo lubelskie, powiat lubelski) – siedziba władz: Jakubowice Murowane
Różnice od 1999 Biskupice (województwo małopolskie, powiat wielicki) – siedziba władz w latach 1999–2011: Trąbki (od 1 stycznia 2012 siedzibą władz gminy są Tomaszkowice) Bystra-Sidzina (województwo małopolskie, powiat suski) – siedziba władz 1999–2015: Bystra (od 1 stycznia 2016 siedzibą władz gminy jest Bystra Podhalańska) Głusk (województwo lubelskie, powiat lubelski) – siedziba władz 1999–2014: Lublin (od 1 stycznia 2015 siedzibą władz gminy jest Dominów) Horyniec (województwo podkarpackie, powiat lubaczowski) – siedziba władz 1999–2001: Horyniec-Zdrój (1 stycznia 2002 r. nastąpiła zmiana nazwy gminy na Horyniec-Zdrój) Kolbudy Górne (województwo pomorskie, powiat gdański) – siedziba władz 1999–2001: Kolbudy (1 stycznia 2002 r. nastąpiła zmiana nazwy gminy na Kolbudy) Lasowice Wielkie (województwo opolskie, powiat kluczborski) – siedziba władz 1999–2005: Lasowice Małe Nowe Miasto Lubawskie (województwo warmińsko-mazurskie, powiat nowomiejski) – siedziba władz 1999–2025: Mszanowo (1 stycznia 2026 r.