W kadencji 2011–2015 członek Komitetu Nauk Teologicznych Polskiej Akademii Nauk. Zasiada też w Komisji Bizantynologicznej PAN. Inicjator serii wydawniczych: Źródła Myśli Teologicznej, Wielcy Ludzie Kościoła.
Publikacje By nie milczeć o Bogu, Kraków: Wydawnictwo Maszachaba, 1991. Orygenes, O zasadach, z jęz. łac. i grec. przeł. i oprac. Stanisław Kalinkowski, fragm. "Filokalii" tł. Katarzyna Augustyniak, wprowadzenie Henryk Pietras, Kraków: Wydawnictwo WAM 1996. Orygenes, Korespondencja, Wydawnictwo WAM Kraków 1997. Źródła Myśli Teologicznej 6. Początki teologii Kościoła, Kraków: Wydawnictwo WAM 2000. Orygenes, Wydawnictwo WAM Kraków 2001. (opr. wraz z A. Baronem), Dokumenty Soborów Powszechnych, t. 1: (325-787), ŹMT 24, Wydawnictwo WAM Kraków 2001. (opr. z A. Baronem), Dokumenty Soborów Powszechnych, t. 2, Kraków: Wydawnictwo WAM 2002. (opr. z A. Baronem), Dokumenty Soborów Powszechnych, t. 3, Kraków: Wydawnictwo WAM 2003. (opr. z A. Baronem), Dokumenty Soborów Powszechnych, t. 4, Kraków: Wydawnictwo WAM 2004. (opr. z A. Baronem), Acta synodalia (Ann. 50-381), Synodi et Collectiones Legum, vol. I, Kraków: Wydawnictwo WAM 2006. (opr. z A. Baronem) Konstytucje Apostolskie, Synodi et Collectiones Legum, vol.