Interfejs użytkownika Windows Me posiadał odziedziczone po Windows 2000 udoskonalenia powłoki systemowej takie jak spersonalizowane menu, modyfikowalne paski narzędziowe Eksploratora Windows, autouzupełnianie w pasku adresów Eksploratora Windows i oknie dialogowym Uruchom, zaawansowane funkcje związane z przypisywaniem formatów plików do aplikacji, wyświetlanie komentarzy do skrótów w tooltipach, rozszerzalne kolumny w widoku szczegółowym (interfejs ), nakładki ikon, inteligentny panel wyszukiwania w Eksploratorze Windows, sortowanie według nazwy funkcji w menu, pasek ostatnio odwiedzanych folderów we wspólnych oknach dialogowych otwierania i zapisywania pliku, kaskadowe specjalne foldery w menu Start, niektóre z kompozycji Plus! 95 i Plus! 98 oraz zaktualizowane grafiki. Obszar powiadomień w Windows Me i późniejszych obsługiwał ikony o 16-bitowej głębi kolorów (). Aplet Multimedia Panelu sterowania został uaktualniony względem poprzednika z Windows 98. Opcje apletu Pasek zadań i Menu Start umożliwiały wyłączenie funkcji przeciągania i upuszczania oraz zapobieganie przemieszczania lub zmiany rozmiaru paska zadań, co stanowiło ułatwienie dla nowych użytkowników.
Ulepszenia wsparcia sprzętu