Lato 2011 rozpoczął 2 lipca od występu w konkursie w Kranju, zaliczanym do klasyfikacji Letniego Pucharu Kontynentalnego 2011, gdzie zajął 25. miejsce. Dzień później uplasował się na 16. pozycji. 9 lipca po raz pierwszy znalazł się w pierwszej dziesiątce – dzięki skokom na 109 m i 110,5 m zajął szóstą pozycję w austriackim Stams. Następnego dnia skoczył na odległość 112,5 m i 94 m, co dało mu 14. lokatę.
Kłusek brał udział w Lotos Poland Tour. Podczas konkursu w Wiśle, był jednym z siedmiu Polaków, którzy zakwalifikowali się do drugiej serii – znalazł się na 24. miejscu, skacząc 114 m i 120,5 m. W Szczyrku skoczył 94 m i 89,5 m, za co sklasyfikowano go na 25. miejscu. Podczas zawodów w Zakopanem zajął 26. miejsce.
W klasyfikacji Lotos Poland Tour znalazł się na szesnastym miejscu.
Podczas rozgrywanych 17 września na Wielkiej Krokwi mistrzostw Polski zawodnik zajął 8. miejsce, po skokach na odległość 119,5 m i 114,5 m.
W dniu 20 stycznia 2012 roku Bartłomiej Kłusek zadebiutował w Pucharze Świata w konkursie w Zakopanem, zajmując 32.