Około roku 1610 w Rzymie przebywał biskup włocławski. Przywiózł on kopię rzymskiego obrazu do Kościerzyny. Obraz ustawiono w drewnianym kościele, który w 1626 r. spłonął. Obraz jednak został uratowany. W 1642 r. wybudowano nowy kościół i w głównym ołtarzu został umieszczony cudowny obraz. W latach 1914 – 1917 wybudowano nowy kościół, który służy do dziś. W ołtarzu bocznym umieszczono obraz Madonny Kościerskiej.
11 października 1970 r. Ks. Biskup Kazimierz Józef Kowalski, ordynariusz chełmiński ustanowił sanktuarium maryjne dla całej ziemi kościerskiej. 7 czerwca 1997 r. Biskup pelpliński Jan Bernard Szlaga nadał pełny tytuł sanktuarium: Matki Bożej Kościerskiej Królowej Rodzin. Wkrótce potem poproszono Ojca Świętego o pozwolenie na Papieską koronację. Ojciec Święty odpowiedział pozytywnie. 11 stycznia 1998 r. zezwolił na ukoronowanie wizerunku Matki Bożej Kościerskiej Królowej Rodzin. Uczyniono to już 16 maja 1998 r.