Kariera zawodowa Na zawodowych ringach zadebiutował 20 marca 2005 pokonując przez techniczny nokaut w drugiej rundzie Davida Vicene. W swoim piętnastym pojedynku 29 marca 2008 doznał pierwszej porażki ulegając przez TKO w trzeciej rundzie z byłym mistrzem WBC Wayne’em Braithwaite’em tracąc pasy WBA Fedelatin oraz WBC Latino. 17 października 2009 zdobył pas IBF Inter-Continental pokonując Enada Licinę. 12 lutego 2011 znokautował w siódmej rundzie Steve’a Hereliusa odbierając mu tymczasowe mistrzostwo federacji WBA. 1 października 2011 pokonał przez techniczną decyzję mistrza świata federacji IBF Steve Cunninghama odbierając mu pas. Walka została przerwana w szóstej rundzie ze względu na rozcięcia twarzy Hernándeza, a o wyniku zadecydowali sędziowie którzy punktowali 57-56 dla Cunninghama oraz 58-55 i 59-54 dla Hernandeza. 4 lutego 2012 doszło do pojedynku rewanżowego, w którym ponownie pokonał Amerykanina, tym razem przez jednogłośną decyzję, broniąc mistrzostwo IBF oraz zdobywając wakujący pas mistrzowski magazynu The Ring.
15 września 2012 w Stechert Arena w Bambergu, w drugiej obronie pasa mistrza świata federacji IBF, pokonał na punkty Kanadyjczyka Troya Rossa (25-2, 16 KO).