Struktura organizacyjna Podstawową jednostką organizacyjną Kościoła jest zbór. Zbory zrzeszone są w senioraty, a senioraty – w dystrykty. Kościół Ewangelicki Wyznania Augsburskiego na Słowacji podzielony jest na dwa dystrykty: zachodni i wschodni oraz na 14 senioratów, z czego osiem przynależy do dystryktu zachodniego, a sześć – do wschodniegoEvanjelická cirkev augsburského vyznania na Slovensku – Internetové stránky jednotlivých zborov v rámci seniorátov..
Dystrykt zachodni (Západný dištrikt): Seniorat myjavski (Myjavský seniorát) Seniorat bratysławski (Bratislavský seniorát) Seniorat powaski (Považský seniorát) Seniorat novohradzki (Novohradský seniorát) Seniorat rymawski (Rimavský seniorát) Seniorat dunajsko-nitrzański (Dunajsko-nitriansky seniorát) Seniorat hontianski (Hontiansky seniorát) Seniorat zwoleński (Zvolenský seniorát)
Dystrykt wschodni (Východný dištrikt): Seniorat turczański (Turčiansky seniorát) Seniorat liptowsko-orawski (Liptovsko-oravský seniorát) Seniorat koszycki (Košický seniorát) Seniorat szarysko-zempliński (Šarišsko-zemplínsky seniorát) Seniorat tatrzański (Tatranský seniorát) Seniorat gemerski (Gemerský seniorát)