W latach 2001–2004 był zatrudniony jako ekonomista ds. Polski i Węgier w Banku Światowym, gdzie zajmował się ponownie reformami finansów publicznych i systemu emerytalnego, doradzając w krajach Europy Środkowo-Wschodniej i Azji Centralnej, a także polityką regionalną i klimatem inwestycyjnym. Od 2003 do 2015 był prezesem Fundacji Klub Obywatelski, założonej w 2002 przez zgromadzenie fundatorów z udziałem Mirosława Czecha, Janusza Lewandowskiego, Aleksandra Smolara, Hanny Suchockiej i Tadeusza Syryjczyka, a zlikwidowanej w maju 2015. Od 2004 do 2008 zajmował stanowisko głównego ekonomisty w Banku BPH. Następnie pracował na stanowisku dyrektora banku ds. strategii i głównego ekonomisty w BRE Banku, po czym do maja 2011 był dyrektorem departamentu relacji inwestorskich i analiz w PKO BP. Według depesz opublikowanych przez WikiLeaks miał być około 2009–2010 nieformalnym doradcą premiera Donalda Tuska, czemu Ryszard Petru zaprzeczał. W latach 2011–2014 był partnerem w firmie PwC, odpowiedzialnym za polskie przedsiębiorstwa prywatne.