W maju 1931 roku za aprobatą ojca, który wyrażał się o postępowaniu syna bardzo przyjaźnie i serdecznieBernd Kasten: Prinz Schnaps. Schwarze Schafe im mecklenburgischen Fürstenhaus. Rostock 2009, S. 104, Fryderyk Franciszek wstąpił do SS i w 1936 roku został promowany do rangi Hauptsturmführer (kapitana). W czasie II wojny światowej został wysłany do Danii, gdzie pracował w ambasadzie Niemiec jako osobisty doradca Wernera Besta. Walczył także na froncie. W 1944 roku służył w elitarnej jednostce Waffen-SS. 11 czerwca 1941 roku Fryderyk Franciszek poślubił córkę Waltera Schapera – (ur. 31 stycznia 1920 we Wrocławiu; zm. 26 stycznia 2012 w Glücksburg). Para rozwiodła się 22 września 1967 roku, ale dziesięć lat później ponownie stanęła na ślubnym kobiercu w dniu 27 kwietnia 1977 roku. Franciszek Fryderyk i Karin Schaper nie mieli dzieci. Małżeństwo z Karin, a także fakt wstąpienia do NSDAP wbrew woli ojca był przyczyną pominięcia Fryderyka Franciszka w kolejce do tronuJonathan Petropoulos: Royals and the Reich. New York: Oxford University Press 2008, S. 128. Fryderyk Franciszek IV w 1943 swoim następcą ogłosił młodszego brata Fryderyka Franciszka – Christiana Ludwika.