W późniejszym czasie przeszedł do drugoligowego CD Leganés, gdzie był jednym z piętnastu swoich rodaków występujących w tym klubie i często pojawiał się w pierwszym składzie, a na koniec rozgrywek 2003/2004 spadł do trzeciej ligi hiszpańskiej.
Latem 2004 Muñoz Mustafá powrócił do ojczyzny, zostając zawodnikiem CA Independiente, w którego barwach występował bez większych sukcesów przez kolejny rok, zdobywając swojego premierowego gola w najwyższej klasie rozgrywkowej; 20 marca 2005 w przegranym 1:2 pojedynku z Boca Juniors, po czym wyjechał do Meksyku, gdzie podpisał umowę z Santosem Laguna z miasta Torreón. W meksykańskiej Primera División zadebiutował 31 lipca 2005 w przegranym 1:2 meczu z Pumas UNAM, a po upływie sześciu miesięcy przeszedł do Atlante FC ze stołecznego miasta Meksyk, który jednak w połowie 2007 roku przeniósł swoją siedzibę do Cancún. Tam od razu wywalczył sobie niepodważalną pozycję na środku obrony, rozgrywając niemal wszystkie spotkania od pierwszej do ostatniej minuty. Premierowego gola w lidze meksykańskiej strzelił 3 marca 2007 w wygranym 3:0 pojedynku z Necaxą, natomiast w jesiennej fazie Apertura 2007 zdobył z Atlante tytuł mistrza Meksyku.