Około roku 1960 wokół źródełka wybudowano drewnianą studnię z drewna dębowego. Pod koniec lat 80. XX wieku, zrodziła się potrzeba zastąpienia kapliczki świątynią. Projekt zatwierdzono 14 września 1980, a 21 czerwca 1981 bp siedlecki Jan Mazur poświęcił kamień węgielny. Budowę świątyni ukończono w 1984 r. 5 lipca 1984 bp ordynariusz odłączył wieś Górki i Izdebnik od parafii w Garwolinie, tworząc tym samym nową parafię w Górkach jako samodzielny Rektorat. Pieczę nad nowo utworzoną parafią objęło Zgromadzenie Świętego Michała Archanioła (CSMA).
Wieści o objawieniach Maryi w Górkach oraz uzdrowienia jakie się dokonują w tym miejscu (także po napiciu się wody ze źródełka lub obmyciu się nią), ściągają systematycznie do Górek coraz więcej pielgrzymów z całej Polski. W wyniku tego ok. roku 2012, zaszła potrzeba rozbudowania kościoła z 1984 r. Obecnie, od roku 2014 trwa ta rozbudowa. Zakończenie prac jest przewidywane na rok 2017.
Sanktuarium Matki Bożej Fatimskiej 27 maja 1997 biskup Jan Wiktor Nowak, wydał dekret: "Przychylając się do prośby duszpasterzy i wiernych parafii Górki k.