Siedziby Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin prowadzi działalność w ośrodkach naukowych w Radzikowie, Boninie, Bydgoszczy, Jadwisinie, Młochowie i Poznaniu. W skład Instytutu wchodzi także siedem Zakładów Doświadczalnych Hodowli i Aklimatyzacji Roślin działających w różnych rejonach kraju. Z dziewięciu Zakładów Doświadczalnych Hodowli i Aklimatyzacji Roślin utworzone zostały w roku 2000 trzy jednoosobowe spółki z ograniczoną odpowiedzialnością.
Historia IHAR został utworzony w 1951 r. jako placówka naukowa do prowadzenia badań w dziedzinie hodowli i nasiennictwa rolniczych roślin uprawnych, technologii uprawy roślin oleistych, korzeniowych i ziemniaka oraz prac wdrożeniowych, upowszechnieniowych, normalizacyjnych i unifikacyjnych w tym zakresieUchwała nr 33 Prezydium Rządu z dnia 24 stycznia 1951 roku w sprawie reorganizacji nauki rolniczej..
W 2006 IHAR zatrudniał 601 osób, w tym w jednostkach naukowych 420 osób, a w zakładach doświadczalnych 181 osób.