miejsce w Serie A (2003, 2006, 2009, 2010), Puchar Włoch 2003, dwukrotnie Superpuchar Włoch (2004, 2011), dwukrotnie Ligę Mistrzów (2003, 2007), dwukrotnie Superpuchar Europy (2003, finał Ligi Mistrzów 2005, 2007) oraz klubowe mistrzostwo świata 2007.
W 2004 roku z okazji 100-lecia FIFA Pelé wybrał Nestę do listy FIFA 100 zawierającą najlepszych żyjących wówczas piłkarzyPelé – FIFA 100 .
Ostatnie lata kariery Po sezonie 2011/2012 odszedł z AC Milanu i związał się z występującym w amerykańskiej lidze MLS Montrealem Impact, z którym podpisał 1,5-roczny kontrakt. Zdobył z klubem w sezonie 2013 Canadian Championship i Walt Disney World Pro Soccer Classic. W październiku 2013 roku oficjalnie poinformował o zakończeniu kariery. Powiedział również, że na kilka miesięcy pragnie odpocząć od futbolu, a następnie ukończyć kursy trenerskie i rozpocząć karierę jako szkoleniowiecOficjalnie: Nesta kończy karierę [data dostępu: 2013-10-20]. Ostatecznie 26 listopada 2014 roku wznowił karierę, podpisując kontrakt z indyjskim FC ChennaiyinOficjalnie: Nesta w Chennaiyin FC [data dostępu: 2014-11-27], jednak w 2015 roku po trzech rozegranych meczach zdecydował się na ostateczne zakończenie kariery piłkarskiej.