Podczas wojny domowej w Mandacie Palestyny w 1948 Holon znalazł się na linii frontu pomiędzy walczącymi ze sobą oddziałami arabskimi i żydowskimi. Arabowie atakowali od strony wioski Tel Arish i sąsiedniego miasta Jafa. Atak Hagany na wieś Tel Arish został krwawo odparty. Członkowie Hagany korzystali w tym okresie z fortu „Hosmasa”, położonego w południowej części Holonu. Poprawę sytuacji przyniosło dopiero zajęcie Jafy (podczas wojny o niepodległość) w dniu 14 maja 1948. Przyśpieszyło to upadek okolicznych arabskich wiosek i zmusiło ludność arabską do ucieczki. Wielu z nich opuściło granice Palestyny i zamieszkało w obozach dla uchodźców.
Po wojnie Holon wchłonął w swoje granice obszar opuszczonych arabskich wiosek Tel Arish i Yazur (arab. يازور). Na części ziemi Yazur powstało żydowskie miasteczko Azor. Holon w ten sposób w ciągu jednego roku podwoił swoją powierzchnię. Pierwsze lata niepodległego Izraela charakteryzowały się dużą imigracją napływającą do kraju z całego świata. Populacja Holonu wówczas również znacznie wzrosła, głównie za sprawą imigrantów pochodzących z arabskich krajów. Wycięto wówczas gaje pomarańczowe i wybudowano nowe osiedla mieszkaniowe oraz strefę przemysłową. 14 listopada 1950 Holon otrzymał prawa miejskie.