Kariera klubowa Cruz Azul Ruiz jest wychowankiem stołecznego zespołu Cruz Azul. Do seniorskiego zespołu został włączony w wieku 23 lat przez trenera Nelsona Acostę. W meksykańskiej Primera División zadebiutował 22 sierpnia 1992 w wygranym 2:1 spotkaniu z Leónem, kiedy to przebywał na placu gry przez pełne 90 minut. Już w kolejnym meczu ligowym, z Tigres UANL (2:2), Ruiz otrzymał pierwszą czerwoną kartkę w karierze (w 40 minucie spotkania). Pierwszą bramkę zawodnik zdobył 27 marca 1993, w wygranym 5:1 meczu z Tecos UAG. Wówczas w 26 minucie otworzył wynik spotkania. Do końca swojego pobytu w Cruz Azul Ruiz był jego podstawowym zawodnikiem. Ponadto w sezonie 1994/95 wywalczył z zespołem La Máquina wicemistrzostwo Meksyku. Stołeczna drużyna w dwumeczu finałowym przegrała z Necaxą łącznym wynikiem 1:3 (1:1, 0:2), jednak Ruiz nie wystąpił w żadnym meczu fazy play–off.