Organy stanowią prywatne użyczenie ofiarodawcy z Kolonii i znajdują się w krypcie wschodniej pod prezbiterium. Zbudowane w stylu włoskiego renesansu jako „organo di legno“ („organy drewniane“) zawierają wyłącznie drewniane piszczałki. Mają strój renesansowy, charakteryzujący się łagodnym, kameralnym brzmieniem.
Organy są wykorzystywane zarówno tak w celach liturgicznych jak i koncertowych.
Organy Klopa stanowią udane dopełnienie architektury krypty, pełnej historycznych wspomnień i promieniującej duchowością; ich forma koresponduje z jej stylizowanym na styl romański surowym wystrojem.
Podobnie jak w wielu kościołach romańskich organy zostały ustawione w pozycji bocznej na lewo od ołtarza. W ten sposób symbolizują związek teologii z muzyką kościelną.
Organy mają następującą dyspozycję:Dyspozycja organów w jęz. włoskim I. Manual CDE-d3 II. Manual CDE-d3 Pedal CDE-d1Principale 8'Ottava 4'Decimaquinta 2'Vigesimaseconda 1' Flauto 4' Decimanona 11/3′Vigesimasesta 2/3′ Voce umana 8′ (od cis1)TremulantNachtigallRegal 8'Pedalkoppeln I i II