niespełna dwa tygodnie później wiceprezydent Zuma, którego kontakty ze skazanym biznesmenem jeden z sędziów określił jako korupcjogenne, otrzymał dymisję z rąk Thabo Mbekiego. W 2006 r. był oskarżony o gwałt, ale został uniewinniony z braku dowodów.
18 grudnia 2007 r. na kongresie ANC został wybrany na stanowisko przewodniczącego partii„New charges for S Africa’s Zuma”, BBC News, 28 grudnia 2007., pokonując prezydenta Mbekiego – cztery tygodnie wcześniej umorzono oskarżenie o korupcję, do czego przyczyniło się rozwiązanie jednostki policyjnej prowadzącej śledztwo i wymiana prokuratora generalnego.
Prezydentura (2009–2018) W wyborach parlamentarnych w kwietniu 2009 r. Afrykański Kongres Narodowy odniósł zwycięstwo, torując w ten sposób Zumie drogę do prezydentury„South Africa’s ANC poised to lead for another five years”, People’s Daily Online, 27 kwietnia 2009.. 6 maja Zuma został wybrany przez członków parlamentu na nowego prezydenta kraju. 9 maja odbyła się oficjalna ceremonia zaprzysiężenia prezydenta„Zuma sworn in as S Africa leader”, BBC News, 9 maja 2009.. Krótko przed objęciem prezydentury zadeklarował zmianę podejścia władz do kwestii epidemii wirusa HIV – jego poprzednik Thabo Mbeki zaprzeczał istnieniu wirusa HIV.