Spadek poziomu wód przyczynia się bezpośrednio do zmiany struktury bagiennych lasów, które przekształcają się w inne siedliska leśne co opisano wielokrotnie w literaturze. Tym samym zanikają rzadkie i ginące rośliny i zwierzęta, w tym ptaki, co ukazuje zagrożenie białowieskiej populacji orlika krzykliwego. W przeciągu ostatnich 15 lat w Puszczy Białowieskiej gnieździ się mniej; bociana czarnego (o 65%), dzięcioła trójpalczastego (o 67%), dzięcioła białogrzbietego (o 55%), kropiatki (o 70%), zielonki (o 60%).
Projekt renaturalizacji Kluczowym elementem w projekcie Górniańskich Łąk było oddzielenie renaturalizowanych obszarów od łąk okolicznych rolników. Problem polegał na tym, że zalewając tereny Górniańskich Łąk, zalane zostałyby tereny rolników z miejscowości Borek, którzy nie chcieli wówczas sprzedać swoich łąk. Tym samym niezbędne okazało się oddzielenie tych terenów 300-metrową groblą (przeciwpowodziową). Dokumentację geodezyjną wykonał A. Domaszewicz, zaś prace techniczne wykonał D. Ochrymiuk i P. Orzechowski. Od tego czasu różnica spiętrzenia wody na Górniańskich Łąkach do łąk rolników z Borka dochodziła do 2 m. Zmeliorowane łąki i pastwiska nabrały charakteru terenów bagiennych.