W 1921 r. władze niepodległej Polski, za zgodą ówczesnych właścicieli Drohojowskich, jako pierwsze uznały Górę Zamkową za ścisły rezerwat przyrody. Ponownie rezerwat o powierzchni 10,28 ha, administrowany przez PPN, utworzono na tych terenach w 1970 r. W 1996 r. został włączony do parku narodowego, jako uroczysko „Zamek Czorsztyn”. Potrzebę ochrony okolicy zamku wywołała obecność rzadkich roślin, m.in. endemitu zachodnich Pienin, pszonaka pienińskiego oraz owadów.

Nazwa mały|Zamek górny i średni, widok z zamku dolnego Według K. Szajnochy nazwa „Czorsztyn” miała pochodzić od (). Zgodnie z inną teorią, wywodzi się od słów lub (, ). Autor hasła o Czorsztynie w słowniku Nazwy miejscowe Polski podaje, że jego nazwa pochodzi od , w znaczeniu stroma skała. Germańska nazwa została nadana przez sprowadzonych ze Spiszu niemieckich osadników.

Zamek Czorsztyn istniał w źródłach równolegle z zamkiem Wronin (castrum Wronyn), co stanowiło podstawę hipotezy o dwóch blisko sąsiadujących ze sobą warowniach. Problem ten rozstrzygnęli w swoich studiach Czesław Deptuła i Stanisław Kołodziejski dowodząc, że Wronin i Czorsztyn to ten sam obiekt. Obalili tym samym teorię, zgodnie z którą zamek o germańsko brzmiącej nazwie mieli założyć Niemcy.