W latach 60. XX wieku miało miejsce prześladowanie Świadków Jehowy ze strony miejscowych władz. W 1961 roku zanotowano liczbę 571 głosicieli; rozbudowano też Biuro Oddziału. W grudniu 1966 roku odbył się kongres międzynarodowy pod hasłem „Synowie Boży – synami wolności”, na którym było 1442 obecnych, w tym 256 delegatów z zagranicy, a wśród nich członkowie Ciała Kierowniczego Świadków Jehowy. Na kongresie 60 osób zostało ochrzczonych. W kraju działało 837 głosicieli. W tym samym roku otwarto rozbudowane Biuro Oddziału. W roku 1974 zorganizowano pomoc humanitarną dla poszkodowanych przez huragan Fifi, a w roku 1976 – dla poszkodowanych przez trzęsienie ziemi. W roku 1978 w San Pedro Sula odbył się kongres pod hasłem „Zwycięska wiara”. W tym samym roku ponownie rozbudowano Biuro Oddziału.
W latach 70. i 80. XX wieku około 40 współwyznawców z Kanady, ze Stanów Zjednoczonych, z Francji, z Niemiec, z Hiszpanii, ze Szwecji i z Japonii przeprowadziło się do Hondurasu, by pomagać w działalności kaznodziejskiej. Przybyli również misjonarze, którzy zostali wydaleni z Nikaragui. W roku 1986 przekroczono liczbę 4 tysięcy głosicieli. 22 października 1989 roku otwarto nowe Biuro Oddziału.