Podczas okupacji hitlerowskiej ksiądz Indyk zorganizował akcje charytatywne, mające za cel pomoc ofiarom wojnyPiotr Pawlina (red.), Rzeczpospolita Mościcka. 80 lat tarnowskich Zakładów Azotowych (1927-2007), Zakłady Azotowe w Tarnowie-Mościcach S.A., Tarnów 2007, ss. 112-113: pracownikom Państwowej Fabryki Związków Azotowych, którzy 1 września 1939 roku nie otrzymali wypłat, uchodźcom z Wielkopolski, ubogim mieszkańcom Mościc, więźniom niemieckich obozów, którym wysyłano paczki z żywnością. Po upadku powstania warszawskiego do Mościc przybyło około 500 wygnańców ze stolicy, którzy dzięki zaangażowaniu proboszcza znaleźli zakwaterowanie. Drugim obszarem zaangażowania księdza Indyka było tajne nauczanie na poziomie szkoły średniej, organizowane przez niego na terenie Mościc i w pobliskiej Zbylitowskiej GórzeMarek Smoła: IV Liceum Ogólnokształcące im. Stanisława Anioła w Tarnowie 1945−2005: Szkoła i ludzie: zarys monograficzny, IV LO i Gimnazjum nr 10 w Tarnowie-Mościcach, Tarnów 2005, , ss. 16-22Czesław Sterkowicz, Tajne nauczanie w Tarnowskiem w latach 1939−1945, Towarzystwo Przyjaciół Ziemi Tarnowskiej, Muzeum Okręgowe, Tarnów 1985. Od 1941 roku, pod pseudonimem „Stanisław Cyran”, był przewodniczącym komisji egzaminacyjnej, która do 1945 roku wydała, między innymi, 67 świadectw maturalnych.