Zawsze, aby przejść dany poziom należy wykorzystać poznane wcześniej zaklęcia, umiejętności czy mikstury.
Oprócz wydarzeń fabularnych, gra zawiera dodatkowe misje poboczne, które są ukryte na każdym z poziomów i w większości lokacji. „Uczeń w niebezpieczeństwie” to grupa wyzwań mających na celu pomoc uczniom w tarapatach, a „Eliksir Wielosokowy” wymaga zdobycia odpowiednich składników i umożliwia tymczasową zmianę wyglądu postaci gracza w jednego z bohaterów, których już odkrył. Gracz może odwiedzić Dziurawy Kocioł, który służy za centralny punkt wyjściowy gry oraz miejsce kupowania bonusów i powrotu do poprzednio rozegranych poziomów. Zamek Hogwart działa za to jak stale rozwijające się centrum, które ukrywa misje poboczne oraz sztony postaci. Po ich zdobyciu możliwy jest zakup odpowiedniego bohateraUK Q&A: LEGO Harry Potter: Years 1-4 – PlayStation Blog..
Dodatkową atrakcją zawartą w grze jest możliwość tworzenia własnych poziomów.
Jeżeli gracz się zgubił, może podążać tropem monet ducha, aby trafić w wymagane miejsce. Nie liczą się one wprost do sumy monet, jednakże gracz może zdobyć bonus sprawiający, że każda moneta ducha otrzymuje wartość 1000LEGO Harry Potter: Years 1-4 Guide/Walkthrough – PS3, PlayStation 3 Walkthrough – IGN..