Masakra na rynku Markale poważnie przyczyniła się do wzrostu antyserbskiego nastawienia wielu publicystów komentujących wojnę w Bośni. Ponadto w kilka dni po tymże wydarzeniu, według badań sondażowych, połowa Amerykanów zadeklarowała poparcie dla zbrojnej interwencji USA w Bośni, podczas gdy miesiąc wcześniej godziła się na nią tylko 1/3 ankietowanych.
W styczniu 2003 Międzynarodowy Trybunał Karny dla byłej Jugosławii uznał gen. Stanislava Galicia za winnego zbrodni przeciwko ludzkości, terroru skierowanego przeciwko ludności cywilnej, ataków na cywilów oraz złamania praw i zwyczajów wojny. Galić jako dowodzący oblężeniem został uznany za winnego m.in. masakry na Markale.
Kontrowersje Kontrowersje w sprawie wzbudzał fakt, iż Markale był otoczony wysokimi budynkami i mógłby zostać trafiony jedynie najprecyzyjniej skierowanym pociskiem moździerzowym. Ponadto na miejscu zdarzenia natychmiast po wybuchu pojawili się dziennikarze, którzy zaczęli filmować dalszy przebieg wydarzeń. Zagraniczne redakcje telewizyjne były zaskoczone szybkością, z jaką otrzymały materiały poświęcone masakrze.