XX wieku klub został zlikwidowany.
10 kwietnia 2008 roku wskutek fuzji klubów: TP Piła, Lotnika Piła i Orła Piła powstało Towarzystwo Piłkarskie Polonia Piła, które kontynuowało historię Międzyzakładowego Klubu Sportowego Polonia Piła. Po rundzie jesiennej sezonu 2015/2016 zespół został wycofany z rozgrywek, a w 2016 roku klub został rozwiązany. W tym samym roku powstał Klub Piłkarski Piła, który zajął miejsce Polonii na piłkarskiej mapie Piły.
Historyczne nazwy 1945 – „Kolejarz” Piła 1957 – Międzyzakładowy Klub Sportowy „Polonia” Piła 1990 – „Polonia/Polam” Piła (fuzja Polonii i Polamu Piła) 1991 – Międzyzakładowy Klub Sportowy „Polonia” Piła 2008 – Towarzystwo Piłkarskie „Polonia” Piła
Sukcesy 3. miejsce w III lidze: 1979/1980 Puchar Polski: 1/32 finału (II runda): 1977/1978
Stadion Polonia domowe mecze rozgrywała głównie na stadionie powiatowym (dawniej stadion Gwardii) przy ulicy Okrzei 4. Sporadycznie na żużlowo-piłkarskim stadionie Polonii przy ulicy Bydgoskiej, gdzie grały rezerwy i juniorskie zespoły Polonii, oraz na lekkoatletyczno-piłkarskim stadionie Miejskiego Ośrodka Sportu i Rekreacji w Pile.