W 2008 roku Međunjanin przeszedł do hiszpańskiego Realu Valladolid. W Realu zadebiutował 14 września 2008 w wygranym 2:1 domowym meczu z Atlético Madryt. W Valladolidzie występował przez dwa sezony i w Primera División rozegrał łącznie 42 spotkania, w których strzelił 6 bramek. W 2010 roku spadł z Realem do Segunda División.
W 2010 roku Međunjanin, po spadku Realu, odszedł za 800 tysięcy euro do izraelskiego Maccabi Tel Awiw, z którym podpisał czteroletni kontrakt. 15 lipca 2010 zaliczył oficjalny debiut w Maccabi, w meczu eliminacji Ligi Mistrzów z czarnogórskim Mogrenem Budva (2:0). Z kolei w lidze izraelskiej po raz pierwszy wystąpił 22 sierpnia 2010 w meczu z Maccabi Hajfa (0:1). W latach 2012–2014 grał w Gaziantepsporze, a w latach 2014–2015 był piłkarzem Deportivo La Coruña. W 2016 wrócił do Maccabi. W styczniu 2017 roku przeniósł się do Philadelphia Union występującego w MLS (Major League Soccer), czyli najwyższej amerykańskiej klasie rozgrywkowej. 25 stycznia 2019 roku Međunjanin przeniósł się do FC Cincinnati (klubu również z MLS) za 900 tys.